Багаторівневий in silico аналіз структур білків WNT1, WNT3A та WNT5A

WNT - родина сигнальних білків, які беруть участь у численних біологічних процесах, включаючи морфогенез, онкогенез, клітинну міграцію та проліферацію, клітинну спеціалізацію та регенерацію тканин.
У дослідженні застосовувався комплексний біоінформаційний підхід, який включав альтернативні аналітичні методи для підвищення точності прогнозів елементів вторинної структури та порівнював моделі третинної структури, створені різними алгоритмами. Найкращі моделі третинних структур WNT були обрані для моделювання молекулярної динаміки (md).
Моделі, які використовуються для md доступні для завантаження та представлені за наведеними нижче посиланнями.
На зображенні оригінальні структури (мінімізовані та врівноважені, перед md) показані синім кольором, моделі після 100 нс симуляції - жовтим, а моделі після 200 нс моделювання - зеленим.

Тривимірні структури білків родини WNT

Повний набір моделей структури білків, які були згенеровані в рамках дослідження (як гомологічним моделюванням, так і за допомогою алгоритмів глибокого навчання), доступні для завантаження у форматі PDB за наступним посиланням (стиснутий файл).